Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMKR1H3BMG3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMKR1H3BMG3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMKR1H3BMG3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMKR1H3BMG3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMKR1H3BMG3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMKR1H3BMG3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMKR1H3BMG3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMKR1H3BMG3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMKR1H3BMG3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMKR1H3BMG3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMKR1H3BMG3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMKR1H3BMG3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMKR1H3BMG3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMKR1H3BMG3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMKR1H3BMG3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMKR1H3BMG3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMKR1H3BMG3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMKR1H3BMG3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms