Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1E9PL57 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms