Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C9orf172C9J069 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf172C9J069 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf172C9J069 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms