Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD1B0YJ81 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms