Protein–RNA interactions for Protein: A6NL88

SHISA7, Protein shisa-7, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA7A6NL88 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA7A6NL88 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA7A6NL88 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms