Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MEIS3P1A6NDR6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MEIS3P1A6NDR6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MEIS3P1A6NDR6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MEIS3P1A6NDR6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MEIS3P1A6NDR6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MEIS3P1A6NDR6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MEIS3P1A6NDR6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MEIS3P1A6NDR6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MEIS3P1A6NDR6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MEIS3P1A6NDR6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MEIS3P1A6NDR6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MEIS3P1A6NDR6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MEIS3P1A6NDR6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MEIS3P1A6NDR6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MEIS3P1A6NDR6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
MEIS3P1A6NDR6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MEIS3P1A6NDR6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms