Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCE3A1L190 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms