Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQS6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQS6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0U1RQS6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQS6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms