Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A0D9SFI3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms