Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 NBPF4-201ENST00000415641 2485 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 NBPF6-202ENST00000495380 2494 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 TUSC5-201ENST00000333813 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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SPOCK3Q9BQ16 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC245297.3-201ENST00000611769 838 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SPOCK3Q9BQ16 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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