Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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