Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms