Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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