Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP7P55210 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP7P55210 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP7P55210 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP7P55210 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP7P55210 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP7P55210 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP7P55210 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP7P55210 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP7P55210 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP7P55210 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP7P55210 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP7P55210 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP7P55210 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP7P55210 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP7P55210 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP7P55210 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP7P55210 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP7P55210 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP7P55210 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP7P55210 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP7P55210 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP7P55210 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP7P55210 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms