Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 MEF2C-207ENST00000503554 1345 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 OBP2A-202ENST00000342114 607 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 TMEM18-203ENST00000405941 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 MAS1LP1-206ENST00000419416 1047 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 APRT-202ENST00000426324 664 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 TRGV2-201ENST00000426402 544 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 ALKBH2-202ENST00000429722 1159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC140481.1-202ENST00000436488 525 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 LINC01194-203ENST00000513051 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 MAF1-204ENST00000532522 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC051619.6-201ENST00000558039 595 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC013356.4-201ENST00000558421 482 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AL121992.3-201ENST00000606186 346 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC068987.3-201ENST00000637934 1195 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 CNMD-201ENST00000377962 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 TAF7L-202ENST00000356784 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 TAF11-202ENST00000420584 1465 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 IGLV2-33-201ENST00000390302 412 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC253536.2-201ENST00000423307 254 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AKIRIN1P2-201ENST00000440655 570 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 PSMD6-209ENST00000482510 1176 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC110753.1-201ENST00000505711 1022 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC007731.1-203ENST00000583722 474 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 SMIM22-201ENST00000586005 366 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 FAM230A-201ENST00000615181 315 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 MIR941-1-201ENST00000636396 72 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 HSD17B3-201ENST00000375262 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 TRGV4-201ENST00000390345 688 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 EEF1GP3-201ENST00000421044 1288 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC013269.2-201ENST00000422631 727 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 PXN-AS1-205ENST00000542314 707 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 ELP5-210ENST00000573657 687 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.198-201ENST00000610617 323 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AL137028.1-201ENST00000620521 555 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 GUCY1A3-213ENST00000621234 1788 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 SERPINA1-220ENST00000636712 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 CDKN2AIPNLP2-201ENST00000274516 352 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 CD300LB-201ENST00000314401 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 KRT18P39-201ENST00000415349 1299 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC016304.1-201ENST00000476363 413 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC133548.2-202ENST00000562267 148 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC133539.1-201ENST00000562644 420 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 MT1G-204ENST00000569500 305 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AL353997.3-201ENST00000586597 589 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AP002414.5-201ENST00000591853 258 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 OSER1-AS1-202ENST00000437730 1563 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.5 ms