Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNFSF9P41273 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms