Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC27P30260 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms