Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms