Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 C1QTNF9B-202ENST00000382140 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 EFHD1-204ENST00000410095 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 UGT1A5-201ENST00000373414 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SKOR2Q2VWA4 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKOR2Q2VWA4 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKOR2Q2VWA4 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKOR2Q2VWA4 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKOR2Q2VWA4 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SKOR2Q2VWA4 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR2Q2VWA4 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR2Q2VWA4 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR2Q2VWA4 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR2Q2VWA4 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR2Q2VWA4 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR2Q2VWA4 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR2Q2VWA4 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR2Q2VWA4 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR2Q2VWA4 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR2Q2VWA4 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR2Q2VWA4 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR2Q2VWA4 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR2Q2VWA4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR2Q2VWA4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKOR2Q2VWA4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms