Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYT16Q17RD7 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms