Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSRNP3Q8WYN3 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms