Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AP003096.1-201ENST00000565199 503 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 CIRBP-AS1-201ENST00000585832 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 KIR3DL3-201ENST00000291860 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 PRY-201ENST00000303728 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 PRY2-201ENST00000303804 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 PRYP3-201ENST00000343584 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 SGCE-201ENST00000265735 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC073585.1-201ENST00000368895 1328 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 PCTP-202ENST00000325214 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 GMPR2-224ENST00000559910 1562 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 SPACA5-201ENST00000304355 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 RSPH1-202ENST00000398352 937 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 LINC00544-201ENST00000400540 1031 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 MBL3P-201ENST00000402234 644 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AL359094.2-201ENST00000420941 750 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AL662860.1-201ENST00000436804 877 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC004771.1-201ENST00000438266 583 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P30-202ENST00000440699 997 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 FTLP16-201ENST00000446400 513 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AL929472.4-201ENST00000447422 691 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AL121992.3-201ENST00000606186 346 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AL356583.1-201ENST00000398739 1371 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 WFDC2-202ENST00000339946 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 WFDC2-204ENST00000372676 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 RN7SL483P-201ENST00000478417 285 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 HDAC2-AS2-216ENST00000522844 808 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC089987.3-201ENST00000551847 588 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms