Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COG3Q96JB2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms