Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMO3Q8TAP4 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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