Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD55Q3KP44 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms