Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ACTBP60709 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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ACTBP60709 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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ACTBP60709 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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ACTBP60709 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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ACTBP60709 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ACTBP60709 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ACTBP60709 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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