Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ATRXP46100 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 SPACA5-201ENST00000304355 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 HTATSF1P1-201ENST00000432008 984 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 RPSAP5-201ENST00000485258 884 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 IGHV1OR16-3-201ENST00000568138 205 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC074366.1-204ENST00000446277 552 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 TMEM255B-205ENST00000488362 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 MYL12A-206ENST00000578611 1004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRXP46100 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 LINC02163-201ENST00000514769 574 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC012572.1-201ENST00000581634 397 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC020663.2-201ENST00000592465 720 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 SLC29A3-201ENST00000373189 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRXP46100 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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