Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms