Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 LINC00299-203ENST00000444688 537 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SIRT1Q96EB6 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms