Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LMO3Q8TAP4 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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