Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 C14orf119-201ENST00000319074 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 DYNC1I1-205ENST00000447467 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TP53-208ENST00000504290 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TP53-220ENST00000610623 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PML-207ENST00000435786 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ADGRF3-202ENST00000333478 3896 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AL592528.1-201ENST00000380008 3466 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LINC01141-203ENST00000426428 2993 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ZNF572-201ENST00000319286 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AKR1C8P-201ENST00000578467 2182 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 RNF4-222ENST00000541204 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ZNF461-204ENST00000588268 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 YWHAB-202ENST00000372839 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AGO2-205ENST00000519980 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SLC4A1AP-206ENST00000618046 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LINC00473-205ENST00000584911 2212 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CELF2-AS1-201ENST00000379256 2468 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CYP1A1-209ENST00000612821 2402 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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