Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP2C1P98194 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms