Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 CDKN2AIPNLP2-201ENST00000274516 352 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC010997.3-201ENST00000418818 502 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AL929472.4-201ENST00000447422 691 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 SSR3-202ENST00000463503 596 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC021439.1-201ENST00000562975 591 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC002519.2-201ENST00000563575 539 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC009061.2-204ENST00000602476 524 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC006581.2-201ENST00000631830 455 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 LYPD4-201ENST00000343055 1051 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 RARRES3-202ENST00000354445 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC023590.1-202ENST00000366457 781 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 HSD17B3-201ENST00000375262 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 FKBP1A-201ENST00000381715 705 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 RNASE11-201ENST00000398008 872 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AL353803.1-201ENST00000439014 800 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 IQCJ-202ENST00000451172 885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC116553.1-201ENST00000561752 397 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC133539.1-201ENST00000562644 420 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 FANCI-214ENST00000567996 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AD000091.1-201ENST00000592379 287 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ZNF544-209ENST00000596929 543 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC012313.2-201ENST00000599952 1154 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 LYPD4-202ENST00000601246 1076 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 MRPL55-212ENST00000366739 641 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 OBP2A-203ENST00000371776 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PTPRMP28827 SYCP3-203ENST00000392927 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 TACR1-202ENST00000409848 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC253536.2-201ENST00000423307 254 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 HLA-DRB6-202ENST00000437183 1090 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC110753.1-201ENST00000505711 1022 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC090192.2-201ENST00000517482 553 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ADIPOR1P2-201ENST00000554199 820 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AL355353.1-201ENST00000604014 330 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 DDX6P2-201ENST00000619520 1455 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC007622.2-202ENST00000546714 1680 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 CSMD2-202ENST00000338325 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
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