Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EPB42P16452 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EPB42P16452 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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