Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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