Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms