Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms