Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms