Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XBP1P17861 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XBP1P17861 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XBP1P17861 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XBP1P17861 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XBP1P17861 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XBP1P17861 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XBP1P17861 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XBP1P17861 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XBP1P17861 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XBP1P17861 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
XBP1P17861 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XBP1P17861 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XBP1P17861 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XBP1P17861 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XBP1P17861 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XBP1P17861 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XBP1P17861 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms