Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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