Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 MAGEA11-202ENST00000355220 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A5-AS1-203ENST00000446986 1874 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 CCDC112-201ENST00000379611 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 DGKZP1-201ENST00000378718 2776 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 PACRG-AS1-201ENST00000626335 2192 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 TMEM185A-210ENST00000613273 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 DNAI2-201ENST00000311014 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 TRPV1-204ENST00000425167 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 ACOXL-202ENST00000389811 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFSF18Q9UNG2 CTAGE7P-201ENST00000435712 2436 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms