Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PPARGC1AQ9UBK2 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PPARGC1AQ9UBK2 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PPARGC1AQ9UBK2 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PPARGC1AQ9UBK2 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PPARGC1AQ9UBK2 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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PPARGC1AQ9UBK2 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PPARGC1AQ9UBK2 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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