Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3AP98173 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms