Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LMO4P61968 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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LMO4P61968 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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LMO4P61968 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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LMO4P61968 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LMO4P61968 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LMO4P61968 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LMO4P61968 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LMO4P61968 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LMO4P61968 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LMO4P61968 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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