Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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ACTBP60709 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ACTBP60709 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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ACTBP60709 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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ACTBP60709 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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ACTBP60709 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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ACTBP60709 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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ACTBP60709 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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ACTBP60709 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ACTBP60709 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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