Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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PTCH1Q13635 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTCH1Q13635 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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