Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms