Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C9orf172C9J069 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf172C9J069 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms