Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HECTD4Q9Y4D8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms