Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMED3Q9Y3Q3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms